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蛋白質分子的結構原理-文庫吧在線文庫

2025-09-18 02:57上一頁面

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【正文】 rimary）肽平面上 Cα C鍵、 C— N 鍵和 NCα 鍵構成長肽鏈的骨架主鏈 ψ 、 ω、 φ 為這 3個鍵軸相應的旋轉角規定由 4個原子 ABC— D 形成的二面角，沿B— C鍵軸俯視，順時針為正相鄰肽單位形成的主鏈結構中 3個鍵軸的旋轉二面角（ ψ 、 ?、 φ ）肽平面上 C— N鍵鍵軸的旋轉角 ω 鍵軸旋轉涉及 2個 Cα 原子的相對位置剛性平面， ω僅有 2種可能 ω=0? 順式結構 ω=180? 反式結構反式結構常見，順式存在空間位阻， ω=180o ω= 0o φ =180、 ψ =180，充分伸展的全反構型 φ =0、 ψ =0，發生嚴重的空間位阻，不能使原子間距離接近甚至小于范德華半徑由二面角決定多肽鏈的構像任何 1個 α 碳原子的（ φ 、 ψ ）二面角發生變化，多肽主鏈骨架構象將產生相應變化幾個或更多個彼此相連殘基，二面角（ φ 、 ψ ）全相同它們即成為有特定規律的構象 φ 、 ψ 分布范圍用 Ramachandran圖表示在這種圖形中甘氨酸分布范圍區域相對大其它殘基角度的分布局限于某些區域殘基側鏈二面角（ φ 、 ψ ） Ramachandran圖對蛋白質的構象研究起到了簡化作用判斷蛋白質結構模型的正誤兩個肽平面之間的相對取向由 C αN 和 C αC兩個可以自由旋轉的單健扭角而定，所以，蛋白質一級結構中肽平面之間扭角的變化，是形成二級結構的基礎兩個肽平面通過 αC原子的結構從生物物理學角度研究蛋白質一級結構的意義在于從蛋白質三維結構的角度來討論與一級結構的關系進一步了解蛋白質結構與功能生物進化蛋白結構預測血型糖蛋白在生物膜上的結構 1 131 仔細分析其 131個氨基酸，不難發現： 73 95 肽鏈從 Ile73~Ile95共 23個氨基酸全為非極性氨基酸，肽鏈的 N端有許多結合多糖的殘基 —— 鑲嵌在脂膜中的那一部分一種跨越紅細胞膜德蛋白質，分子的一部分伸向胞外，一部分在胞質中，還有一部分嵌在膜里 —— 肽鏈的前 70個殘基應伸向膜外膜外 φ 、 ψ 的取值關系到主鏈側鏈原子或基團的空間位置，天然構象處于穩定的低勢能狀態能量對二面角（ φ 、 ψ ）分布的影響非鍵作用能偶極相互作用能單鍵旋轉的本征扭轉能考慮主要 3類能量非鍵作用能 EKL（ φ 、 ψ ）非鍵作用能 EKL（ φ 、 ψ ）任意 2個原子或粒子間的推斥力范德華力吸引力二面角（ φ 、 ψ ）的變化導致各原子或基團間位置改變偶極作用能 Ed（ φ 、 ψ ）偶極作用能 Ed（ φ 、 ψ ） C=O和 NH在肽平面上產生的偶極矩約為 φ 、 ψ 改變影響到偶極矩間的相互作用單鍵旋轉的本征扭轉能 Etor（ φ 、

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