第三章3-核酸序列的基本分析-(20xx)(專業版)

　　

【正文】 核酸序列分析 內容： ? 污染序列的去除 ? 閱讀框架（ Open reading frame,ORF） ? 對分子量、堿基組成、堿基分布、序列轉換 ? 酶切位點的識別和分析 重點 ? PRIMER軟件的使用 一、污染序列的去除 ?序列污染：指一個被檢索序列（ 如測序的序列 ）含有一個外源序列因而無法反映其來源物種的真實遺傳信息 序列污染的來源 ? （ vecscreen） ? PCR引物 ? ? 基因序列 載體序列 引物 引物 如何識別和去除載體序列和判斷引物序列等， vecscreen 如何識別和去除載體序列和判斷引物序列等， 通過 align比對 通過 vecscreen操作 通過 align比對可找出擴增 gfp的引物 gfp 720bp 但突變的 gfp 762bp 》 GFP1 ATGGTGAGCAAG GGCGAGGAGC TGTTCACCGG GGTGGTGCCC ATCCTGGTCG AGCTGGACGG CGACGTAAAC GGCCACAAGT TCAGCGTGTC CGGCGAGGGC GAGGGCGATG CCACCTACGG CAAGCTGACC CTGAAGTTCA TCTGCACCAC CGGCAAGCTG CCCGTGCCCT GGCCCACCCT CGTGACCACC CTGACCTACG GCGTGCAGTG CTTCAGCCGC TACCCCGACC ACATGAAGCA GCACGACTTC TTCAAGTCCG CCATGCCCGA AGGCTACGTC CAGGAGCGCA CCATCTTCTT CAAGGACGAC GGCAACTACA AGACCCGCGC CGAGGTGAAG TTCGAGGGCG ACACCCTGGT GAACCGCATC GAGCTGAAGG GCATCGACTT CAAGGAGGAC GGCAACATCC TGGGGCACAA GCTGGAGTAC AACTACAACA GCCACAACGT CTATATCATG GCCGACAAGC AGAAGAACGG CATCAAGGTG AACTTCAAGA TCCGCCACAA CATCGAGGAC GGCAGCGTGC AGCTCGCCGA CCACTACCAG CAGAACACCC CCATCGGCGA CGGCCCCGTG CTGCTGCCCG ACAACCACTA CCTGAGCACC CAGTCCGCCC TGAGCAAAGA CCCCAACGAG AAGCGCGATC ACATGGTCCT GCTGGAGTTC GTGACCGCCG CCGGGATCAC TCT