生物化學名詞解釋總-石油化工(編輯修改稿)

　

【文章內容簡介】 形成氫鍵與膜的內、外表面弱結合的膜蛋白。膜蛋白一旦從膜上釋放出來，通常都是水溶性的。 流體鑲嵌模型 (fluid mosaic model)： 針對生物膜的結構提出的一種模型。在這個模型中，生物膜被描述成鑲嵌有蛋白質的流體脂雙層，脂雙層在結構和功能上都表現出不對稱性。有的蛋白質 鑲 在脂雙層表面，有的則部分或全部嵌入其內部，有的則橫跨整個膜。另外脂和膜蛋白都可以進行橫向擴散。 通透系數（ permeability coefficient） : 是離子或小分子擴散過脂雙層膜能力的一種量度。 通道 蛋白（ channel proteins） : 是一種帶有中央水相通道的內在膜蛋白，它可以使大小合適的離子和分子從膜的任一方向穿過膜。 （膜）孔蛋白（ pore proteins） :其含義與通道蛋白類似，只是該術語常用于細菌。 被動轉運（ passive transport）： 也稱之易化擴散（ facilitated diffusion）。是一種轉運方式，通過該方式溶質特異結合于一個轉運蛋白，然后被轉運過膜，但轉運是沿著濃度梯度下降方向進行，所以被動轉運不需要能量支持。 主動轉運（ active transport） : 一種轉運方式，通過該方式溶質特異結合于一個轉運蛋白，然后被轉運過膜，但與被動轉運方式相反轉運是逆著濃度梯度方向進行的，所以主動轉運需要能量來驅動。在原發主動轉運過程中，能源可以是光、 ATP 或電子傳遞。而第二級主動轉運是在離子濃度梯度驅動下進行的。 協同運送 (cotransport)： 兩種不同溶質跨膜的耦聯轉運。可以通過一個轉運蛋白進行同一方向（同向轉運）或反方向（反向轉運）轉運。 胞吞（作用）（ endocytosis）： 物質被質膜吞入并以膜衍生出的脂囊泡形式（物質在囊泡內）并被帶入到細胞內的過程。 胞吐（作用）（ exocytosis）： 確定要分泌的物質被包裹在脂囊泡內，該囊泡與質膜融合，然后將物質釋放到細胞外空間的過程。 核苷（ nucleoside） : 是由嘌呤或嘧啶堿基通過共價鍵與戊糖連接組成的化合物。核糖與堿基一般都是由糖的異頭碳與嘧啶的 N1 或嘌呤的 N9 之間形成的β N糖苷鍵連接的。 核苷酸（ nucleotide）：核苷的戊糖成分中的羥基磷酸化形成的化合物。 cAMP（ cyclic AMP） : 3ˊ ,5ˊ 環腺苷酸，細胞內的第二信使，由于某些激素或其它分子信號刺激激活腺苷酸環化酶催化 ATP 環化形成的。 磷酸二酯鍵（ phosphodiester linkage）： 一種化學基團，指一分子磷酸與兩個醇（羥基）酯化形成的兩個酯鍵。該酯鍵成了兩個醇之間的橋梁。例如一個核苷的 3ˊ羥基與另一個核苷的 5ˊ羥基與同一分子磷酸酯化，就形成了一個磷酸二酯鍵。 脫氧核糖核酸（ DNA , deoxyribonucleic acid） : 含有特殊脫氧核糖核苷酸序列的聚脫氧核苷酸，脫氧核苷酸之間是通過 3ˊ ,5ˊ 磷酸二酯鍵連接的。 DNA 是遺傳信息的載體。 核糖核酸（ RNA , ribonucleic acid） : 通過 3ˊ ,5ˊ 磷酸二酯鍵連接形成的特殊核糖核苷酸序列的聚核糖核苷酸。 核糖體核糖核酸（ rRNA, ribosomal robonucleic acid）： 作為核糖體組成成分的一類 RNA， rRNA 是細胞內最豐富的 RNA。 信使核糖核酸（ mRNA, messenger ribonucleic acid）：一類用作蛋白質合成模板的 RNA。 轉移核糖核酸（ tRNA, transfer ribonucleic acid）： 一類攜帶激活氨基酸，將它帶到蛋白質合成部位并將氨基酸整合到生長著的肽鏈上的 RNA。 tRNA 含有能識別模板 mRNA 上互補密碼的反密碼。 轉化（作用）（ transformation） : 一個外源 DNA 通過某種途徑導入一個宿主菌，引起該細菌的遺傳特性改變的作用。 轉導（作用）（ transduction） : 借助于病毒載體，遺傳信息從一個細胞轉移 到另一個細胞。 堿基對（ base pair）： 通過堿基之間氫鍵配對的核酸鏈中的兩個核苷酸，例如 A 與 T 或 U，以及 G與 C 配對。 查格夫法則（ Chargaffs rules）： 所有 DNA 中腺嘌呤與胸腺嘧啶的摩爾含量相等，（ A＝ T），鳥嘌呤和胞嘧啶的摩爾含量相等（ G＝ C），即嘌呤的總含量與嘧啶的總含量相等（ A＋ G＝ T＋ C）。DNA 的堿基組成具有種的特異性，但沒有組織和器官的特異性。另外生長發育階段、營養狀態和環境的改變都不影響 DNA 的堿基組成。 DNA 雙螺旋 (DNA double helix)： 一種核酸的構象，在該構象中，兩條反向平行的多核苷酸鏈圍繞彼此纏繞形成一個右手的雙螺旋結構。堿基位于雙螺旋內側 ,磷酸與糖基在外側，通過磷酸二酯鍵相連 ,形成核酸的骨架。堿基平面與假想的中心軸垂直 ,糖環平面則與軸平行。兩條鏈皆為右手螺旋。雙螺旋的直徑為 2nm，堿基堆積距離為 ，兩核苷酸之間的夾角是 36176。，每對螺旋由 10 對堿基組成，堿基按 AT, GC 配對互補，彼此以氫鍵相連系。維持 DNA 雙螺旋結構穩定的力主要是堿基堆積力。雙螺旋表面有兩條寬窄、深淺不一的一 個大溝和一個小溝。 大溝 (major groove)和小溝 (minor groove)： 繞 BDNA 雙螺旋表面上出現的螺旋槽（溝），寬的溝稱之大溝，窄溝稱之小溝。大溝、小溝都是由于堿基對堆積和糖 磷酸骨架扭轉造成的。 DNA 超螺旋（ DNA supercoiling） : DNA 本身的卷曲，一般是 DNA 雙螺旋的彎曲、欠旋（負超螺旋）或過旋（正超螺旋）的結果。 拓撲異構酶（ topoisomerase） : 通過切斷 DNA 的一條或兩條鏈中的磷酸二酯鍵，然后重新纏繞和封口來改變 DNA 連環數的酶。拓撲異構酶 I通過切斷 DNA 中的一條鏈減少負超螺旋，增加一個連環數；而拓撲異構酶 II 切斷 DNA 的兩條鏈增加負超螺旋，減少 2 個連環數。某些拓撲異構酶 II 也稱之 DNA 促旋酶。 核小體（ nucleosome）：用于包裝染色質的結構單位，是由 DNA 鏈繞一個組蛋白核纏繞構成的。 染色質 (chromatin)： 是存在于真核生物間期細胞核內，易被堿性染料著色的一種無定形物質。染色質中含有作為骨架的完整的雙鏈 DNA，以及組蛋白、 非組蛋白和少量的 RNA。 染色體 (chromosome)： 是染色質在細胞分裂過程中經過緊密纏繞、折疊、凝縮和精細包裝形成的具有固定形態的遺傳物質存在形式。簡言之，染色體是一個大的單一的雙鏈 DNA分子與相關蛋白質組成的復合物， DNA 中含有許多基因，貯存和傳遞遺傳信息。 DNA 變性 (DNA denaturation)： DNA 雙鏈解鏈分離成兩條單鏈的現象。 退火（ annealing） : 即 DNA 由單鏈復性變成雙鏈結構的過程。來源相同的 DNA 單鏈經退火后完全恢復雙鏈結構，同源 DNA 之間、 DNA 和 RNA 之間退火后形成雜交分子。 融解溫度 (melting temperature, Tm)： 雙鏈 DNA 融解徹底變成單鏈 DNA 的溫度范圍的中點溫度。 增色效應（ hyperchromic effect）： 當雙螺旋 DNA 融解（解鏈）時， 260nm 處紫外吸收增加的現象。 減色效應（ hypochromic effect）：隨著核酸復性，紫外吸收降低的現象。 核酸內切酶 (endonuclease)： 核糖核酸酶和脫氧核糖核酸酶中能夠水解核酸分子內磷酸二酯鍵的酶。 核酸外切酶 (exonuclease)：從核酸鏈的一端逐個水解下核苷酸的酶。 限制性內切酶（ restriction endonucleases） : 一種在特殊核苷酸序列處水解雙鏈 DNA 的內切酶。 I 型限制性內切酶既催化宿主 DNA 的甲基化，又催化非甲基化的 DNA 的水解；而 II 型限制性內切酶只催化非甲基化的 DNA 的水解。 限制酶圖譜 (restriction map)： 同一 DNA 用不同的限制酶進行切割從而獲得各種 限制酶的切割位點，由此建立的位點圖譜有助于對 DNA 的結構進行分析。 反向重復序列 (inverted repeat sequence)： 在同一多核苷酸鏈內的相反方向上存在的重復的核苷酸序列。在雙鏈 DNA中反向重復可能引起十字形結構的形成。 重組 DNA 技術（ rebination DNA technology） : 也稱之基因工程 (genomic engineering)。利用限制性內切酶和載體，按照預先設計的要求，將一種生物的某種目的基因和載體 DNA 重組后轉人另一生物細胞中進行復制、轉錄和表達的技術。 基因（ gene） : 也稱之順反子（ cistron）。泛指被轉錄的一個 DNA 片段。在某些情況下，基因常用來指編碼一個功能蛋白或 RNA 分子的 DNA 片段。 分解代謝反應（ catabolic reaction） : 降解復雜分子為生物體提供小的構件分子和能量的代謝反應。 合成代謝反應（ anabolic reaction）： 合成用于細胞維持和生長所需要的分子的代謝反應。 反饋抑制（ feedback inhibition） ： 催化一個代謝途徑中前面反應的酶受到同一途徑的終產物抑制的現象。 前饋激活（ feedforward activation）： 代謝途徑中一個酶被該途徑中前面產生的代謝物激活的現象。 標準自由能變化（Δ G176。）（ standard freeenergy change） : 在一系列標準條件（溫度： 298K；壓力： 1 個大氣壓；所有溶質的濃度都是1M）下發生的反應的自由能變化。Δ G176。ˊ表示 條件下的標準自由能變化。 標準還原電位（ E176。ˊ） （ standard reduction potential）： 25℃和 1M濃度下表現出的電動勢。 酵解 (glycolysis)： 一個由 10 步酶促反應組成的糖分解代謝途徑，通過該途徑，一分子葡萄糖轉換為兩分子丙酮酸，同時凈生成兩分子 ATP 和兩分子 NADH。 發酵 (fermentation)： 營養分子（例如葡萄糖）產能的厭氧降解，在乙醇發酵中，丙酮酸轉化為乙醇和 CO2。 巴斯德效應 (Pasteur effect)：氧存在下，酵解 速度放慢的現象。 底物水平磷酸化 (substrate phosphorylation)： ADP 或某些其它的核苷 5ˊ 二磷酸的磷酸化是通過來自一個非核苷酸底物的磷酰基的轉移實現的。這種磷酸化與電子傳遞鏈無關。 檸檬酸循環（ citric acid cycle） : 也稱之三羧酸循環 (tricarboxylic acid cycle)， Krebs 循環（ Krebs cycle）。是用于乙酰 CoA 中的乙酰基氧化生成 CO2 的酶促反應的循環系統，該循環的第一步反應是由乙酰 CoA 和草酰乙酸縮 合形成檸檬酸。 回補反應（ anaplerotic reaction）： 酶催化的補充檸檬酸循環中間代謝物的供給的反應，例如由丙酮酸羧化生成草酰乙酸的反應。 乙醛酸循環（ glyoxylate cycle） : 是某些植物、細菌和酵母中檸檬酸循環的修改形式，通過該循環可以由乙酰CoA 經草酰乙酸凈生成葡萄糖。乙醛酸循環繞過了檸檬酸循環中生成兩個 CO2的步驟。 戊糖磷酸途徑（ pentose phosphate pathway）： 也稱之磷酸己糖支路（ hexose monophosphate shunt）。是一個葡萄糖 6磷酸經代謝產生 NADPH 和核糖 5磷酸的途徑。該途徑包