生物化學——名詞解釋(doc210)-石油化工-資料下載頁

【導讀】是含有一個堿性氨基和一個酸性羧基的有機化合物，氨基一般連接在α-碳上。和蛋白質的構件分子。氨酸、丙氨酸等氨基酸。使分子處于兼性分子狀態，在電場中不遷移的pH值。在加熱條件下，氨基酸或肽與茚三酮反應生成紫色化合物的反應。一個氨基酸的羧基與另一個氨基酸的氨基縮合，除去一分子水形成的酰胺鍵。蛋白質一級結構：指蛋白質中共價連接的氨基酸殘基的排列順序。成分分開的技術。按照分子大小分離蛋白質或其它分子混合物的層析技術。以凝膠為介質，在電場作用下分離蛋白質或核酸等分子的分離純化技術。從多肽鏈游離的N末端測定氨基酸殘基的序列的過程。來自不同種類生物、而序列和功能類似的蛋白質。是蛋白質中的常見的二級結構，是由伸展的多肽鏈組成的。鏈走向改變的一種非重復多肽區，一般含有2～16個氨基酸殘基。含有5個氨基酸殘基以。常見的轉角含有4個氨基酸殘基，有兩種類型。

　　

【正文】 字型結構，在復制叉處作為模板的雙鏈 DNA 解旋，同時合成新的 DNA 鏈。 DNA 聚合酶（ DNA polymerase）： 以 DNA為模板催化核苷酸殘基加到已存在的聚核苷酸的 3ˊ末端反應的酶。某些 DNA聚合酶具有外切核酸酶的活性，可用來校正新合成的核苷酸序列。 Klenow 片段 (Klenow fragment)： DNA 聚合酶 I 經部分水解生成的 C 末端 605 個氨基酸殘基片段。該片段保留了 DNA聚合酶 I 的 5ˊ 3ˊ聚合酶和 3ˊ 5ˊ外切酶活性，但缺少完整酶的 5ˊ 3ˊ外切酶活性。 前導鏈（ leading strand）： 與復制叉移動的方向一致，通過連續地 5ˊ→ 3ˊ聚合合成的新的 DNA 鏈。 滯后鏈（ lagging strand）： 與復制叉移動的方向相反，通過不連續地 5ˊ→ 3ˊ聚合合成的新的 DNA 鏈。 岡崎片段 (Okazaki fragments)： 相對比較短的 DNA 鏈（大約 1000 核苷酸殘基），是在 DNA 的滯后鏈的不連續合成期間生成的片段，這是 Reiji Okazaki 在 DNA合成實驗中添加放射性的脫氧核苷酸前體觀察到的。 引發體（ primosome） :一種多蛋白復合體， 中的引發體包括催化滯后鏈不連續 DNA合成所需要的短的 RNA 引物合成的引發酶、解旋酶。 復制體 (replisome)： 一種多蛋白復合體，包含 DNA 聚合酶、引發酶、解旋酶、單鏈結合蛋白和其它輔助因子。復制體位于每個復制叉處執行著細菌染色體 DNA 復制的聚合反應。 單鏈結合蛋白（ SSB， singlestrand binding protein） : 一種與單鏈 DNA 結合緊密的蛋白質，它的結合可以防止復制叉處的單鏈 DNA本身重新折疊回雙鏈區。 滾環復制（ rollingcircle replication）： 復制環狀 DNA 的一種模式，在該模式中， DNA 聚合酶結合在一個缺口鏈的 3ˊ端，繞環合成與模板鏈互補的 DNA，每一輪都是新合成的 DNA 取代前一輪合成的 DNA。 逆轉錄酶（ reverse transcriptase） : 一種催化以 RNA 為模板合成 DNA 的 DNA 聚合酶，具有 RNA 指導的 DNA 合成、水解 RNA和 DNA 指導的 DNA 合成的酶活性 。 互補 DNA (cDNA , plementary DNA)： 通過逆轉錄酶由 mRNA 模板合成的雙鏈 DNA。 聚合酶鏈式反應（ PCR, polymerase chain reaction） : 擴增樣品中的 DNA 量和富集眾多 DNA 分子中的一個特定 DNA 序列的一種技術。在該反應中，使用與目的 DNA 序列互補的寡核苷酸作為引物，進行多輪的 DNA 合成。其中包括 DNA 中國最大的管理資料下載中心 (收集 \整理 . 部分版權歸原作者所有 ) 第 15 頁 共 17 頁 變性、引物退火和在 Taq DNA 聚合酶催化下的 DNA 合成。 直接修復（ direct repair） : 是通過一種可連續掃描 DNA，識別出損傷部位 的蛋白質將損傷部位直接修復的方法。該修復方法不用切斷 DNA 或切除堿基。 切除修復（ excision repair） : 通過切除 修復內切酶使 DNA 損傷消除的修復方法。一般是切去損傷區，然后在 DNA 聚合酶的作用下以露出的單鏈為模板合成新的互補鏈，最后用連接酶將缺口連接起來。 錯配修復（ mismatch repair） : 在含有錯配堿基的 DNA分子中使正常核苷酸序列恢復的修復方式。這種修復方式的特點是：識別出正確的鏈，切除掉不正確鏈的部分，然后通過 DNA 聚合酶和 DNA連接酶的作用合成正確配對的雙鏈 DNA。 遺傳學中心法則（ geic central dogma） : 描述從一個基因到相應蛋白質的信息流的途徑。遺傳信息貯存在 DNA中， DNA 被復制傳給子代細胞，信息被拷貝或由 DNA 被轉錄成 RNA，然后 RNA 被翻譯成多肽鏈。不過由于逆轉錄酶的發現，也可以以 RNA 為模板合成 DNA。 轉錄（ transcription） :在由 RNA聚合酶和輔助因子組成的轉錄復合體的催化下，從雙鏈 DNA分子中拷貝生物信息生成單一一條 RNA 鏈的過程。 模板鏈 (template strand)： 可作為模板轉錄為 RNA 的那條鏈，該鏈與轉錄 的 RNA 堿基互補（ AU, GC）。在轉錄過程中， RNA聚合酶與模板鏈結合，并沿著模板鏈的 3ˊ→ 5ˊ方向移動，按照 5ˊ→ 3ˊ方向催化 RNA 的合成。 編碼鏈（ coding strand）： 雙鏈 DNA中，不能進行轉錄的那條 DNA鏈 ,該鏈的核苷酸序列與轉錄生成的 RNA 的序列一致（在 RNA中是以 U 取代了 DNA中的 T）。 核心酶 (core enzyme)： 大腸桿菌的 RNA 聚合酶全酶由五個亞基（α 2ββ 39。δ）組成，沒有δ亞基的酶叫核心酶。核心酶只能使已開始合成的 RNA鏈延長，但不具有起始合成 RNA 的能力，必需加入δ 亞基才表現出全部聚合酶的活性。 RNA 聚合酶 (RNA polymerase)： 以一條 DNA 鏈或 RNA 為模板催化由核苷 5ˊ 三磷酸合成RNA 的酶。 啟動子（ promoter） : NA 分子中 RNA 聚合酶能夠結合并導致轉錄起始的序列。 內含子（ introns）： 在轉錄后的加工中，從最初的轉錄產物除去的內部的核苷酸序列。術語內含子也指編碼相應 RNA 內含子的 DNA 中的區域。 外顯子（ exons）： 既存在于最初的轉錄產物中，也存在于成熟的 RNA分子中的核苷酸序列。術語外顯子也指編碼相應 RNA 外顯子的 DNA 中的區域。 終止因子 (termination factors)： 協助 RNA 聚合酶識別終止信號的輔助因子（蛋白質）。 核酶（ ribozymes）： 具有象酶那樣催化功能的 RNA 分子。 剪接體（ spliceosome） :大的蛋白質 RNA 復合體，它催化內含子從 mRNA 前體中除去的反應。 RNA 加工過程（ RNA processing）： 將一個 RNA 原初轉錄產物轉換成成熟 RNA 分子的反應過程。加工包括從原初轉錄產物中刪除一些核苷酸，添加一些基因沒有編碼的核苷酸，和對某些堿基進行共價修飾。 RNA 剪接（ RNA splicing）： 從 DNA 模板鏈轉錄出的最初轉錄產物中除去內含子，并將外顯子連接起來形成一個連續的 RNA 分子的過程。 翻譯（ translation）： 在蛋白質合成期間將存在于 mRNA 上代表一個多肽鏈的核苷酸殘基序 中國最大的管理資料下載中心 (收集 \整理 . 部分版權歸原作者所有 ) 第 16 頁 共 17 頁 列轉換為多肽鏈氨基酸殘基序列的過程。 遺傳密碼（ geic code） : 核酸中的核苷酸殘基序列與蛋白質中的氨基酸殘基序列之間的對應關系。連續的 3個核苷酸殘基序列為一個密碼，特指一個氨基酸。標準的遺傳密碼是由 64個密碼組成的，幾乎為所有生物通用。 起始密碼（ iniation codon）： 指定蛋白質合成起 始位點的密碼。最常見的起始密碼是蛋氨酸密碼： AUG。 終止密碼（ termination codon）： 任何 tRNA分子都不能正常識別的、但可被特殊蛋白結合并引起新合成的肽鏈從翻譯機器上釋放的密碼。存在三個終止密碼： UAG， UAA 和 UGA。 密碼子 (codon)： mRNA（或 DNA）上的三聯體核苷酸殘基序列，該序列編碼著一個指定的氨基酸， tRNA 的反密碼子與 mRNA 的密碼子互補。 反密碼子（ anticodon） : tRNA 分子的反密碼環上的三聯體核苷酸殘基序列。在翻譯期間，反密碼與 mRNA中的互補密碼結 合。 簡并密碼子 (degenerate codon)： 也稱之同義密碼子（ synonymous codon）。是指編碼相同氨基酸的幾個不同的密碼子。 氨基酸臂（ amino arm） :也稱之接納莖（ acceptor stem）。 tRNA 分子中靠近 3ˊ端的核苷酸序列和 5ˊ端的序列堿基配對，形成的可接收氨基酸的臂（莖）。 Tψ C臂（ Tψ C arm）： tRNA 中含有胸腺嘧啶核苷酸 假尿嘧啶核苷酸 胞嘧啶核苷酸殘基序列的莖環結構。 氨酰 tRNA（ aminoacyltRNA）： 在氨基酸臂的 3ˊ端的腺苷酸殘基共價連接 了氨基酸的 tRNA分子。 同工 tRNA（ isoacceptor tRNA）： 結合相同氨基酸的不同的 tRNA分子。 擺動 (wobble) ： 處于密碼子 3ˊ端的堿基和與之互補的反密碼的 5ˊ端的堿基之間的堿基配對有一定的寬容性，即處于反密碼的 5ˊ端的堿基（也稱之擺動位置），例如 I 可以與密碼子上 3ˊ端的 U、C 和 A 配對。由于存在擺動現象所以使得一個 tRNA反密碼子可以和一個以上的 mRNA密碼子結合。 氨酰 tRNA 合成酶（ aminoacyltRNA synthetase）： 催化特定氨基酸激活并共價結合在相應的 tRNA分子 3ˊ端的酶。 翻譯起始復合體（ translation initiation plex）： 由核糖體亞基、一個 mRNA 模板、一個起始的 tRNA 分子和起始因子組成并組裝在蛋白質合成起始點的復合體。 讀碼框 ( reading frame)： 代表一個氨基酸序列的 mRNA 分子的非重疊密碼序列。一個 mRNA的讀碼框是由轉錄起始位置（通常是 AUG密碼）確定的。 SD序列（ ShineDalgarno sequence）： mRNA 中用于結合原核生物核糖體的序列。 肽酰轉移酶（ peptidyl transferase）： 蛋白質合成期間負責轉移肽酰基和催化肽鍵形成的酶。 嘌呤霉素（ puromycin）： 通過整合到生長著的肽鏈，引起肽鏈合成提前終止來抑制多肽鏈合成的一種抗生素。 開放讀碼框 (open reading frame)： DNA 或 RNA 序列中一段不含終止密碼的連續的非重疊核苷酸密碼。 信號肽（ signal peptide） :常指新合成多肽鏈中用于指導蛋白質跨膜轉移（定位）的 N末端的氨基酸序列（有時不一定在 N端）。 中國最大的管理資料下載中心 (收集 \整理 . 部分版權歸原作者所有 ) 第 17 頁 共 17 頁 轉錄因子（ transcription factor）： 在轉錄起始復合體的組裝過程中，與啟 動子區結合并與 RNA聚合酶相互作用的一種蛋白質。某些轉錄因子在 RNA 延伸時一直維持著結合狀態。 操縱子（ operons） :是由一個或多個相關基因以及調控它們轉錄的操縱基因和啟動子序列組成的基因表達單位。 操縱基因（ operator）： 與特定阻遏蛋白相互作用調控一個基因或一組基因表達的 DNA 區。 結構基因（ structural gene）： 編碼一個蛋白質或一個 RNA 的基因。 轉錄激活劑（ transcriptional activator）： 通過增加 RNA 聚合酶的活性來加快轉錄速度的一種調節 DNA 結合蛋白。 阻遏物（ repressor）： 與一個基因的調控序列或操縱基因結合以阻止該基因轉錄的一類蛋白質。 衰減作用（ attenuation）： 一種翻譯調控機制。在該機制中，核糖體沿著 mRNA 分子的移動的速率決定轉錄是進行還是終止。 亮氨酸拉鏈（ leucine zipper） : 出現在 DNA 結合蛋白質和其它蛋白質中的一種結構基元（ motif）。當來自同一個或不同多肽鏈的兩個兩性的α 螺旋的疏水面（常常含有亮氨酸殘基）相互作用形成一個圈對圈的二聚體結構時就形成了亮氨酸拉鏈。 鋅指（ zinc finger）： 也是一種常出現 在 DNA 結合蛋白質中的一種結構基元。是由一個含有大約 30個氨基酸殘基的環和一個與環上的 4 個 Cys或 2 個 Cys和 2 個 His配位的 Zn2＋構成，形成的結構象個手指狀。