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蛋白質的三維結構ppt課件(編輯修改稿)

2026-05-29 08:56 本頁面

　

【文章內容簡介】酰胺、色氨酸等。 β轉角目錄 β轉角作用力 —— 同樣是肽鍵衍生來的氫鍵但由于只有這一個氫鍵，只形成β — 轉角結構。 O …… （氫鍵） ……… H — C— （ NH— CH— CO） 2— N— R 目錄 ? 轉角是球狀蛋白質分子中出現的 180176。回折，有人稱之為發夾結構。 ? 轉角的特征： ①由多肽鏈上 4個連續的氨基酸殘基組成。 ②主鏈骨架以 180176。返回折疊。 ③第一個 C=O與第四個 NH生成氫鍵 ④ C1? 與 C4? 之間距離小于 ⑤ 多數由親水氨基酸殘基組成。在 ? 轉角中第一個殘基地 C=O與第四個殘基地 NH氫鍵鍵合，形成一個緊密地環，使 ? 轉角成為比較穩定地結構。由于甘氨酸缺少側鏈（只有一個 H），在 ? 轉角中能很好地調整其他殘基地空間阻礙，因此是立體化學上最合適地氨基酸，而脯氨酸具有環狀結構和固定的 φ 角，因此在一定程度上迫使 ? 轉角形成，促進多肽鏈自身回折。目錄 β凸起 (了解 ) ? 凸起是一種小片的非重復性結構，能單獨存在，大多數經常作為反平行 ? 折疊片中的一種不規則情況而存在。 ? 凸起可認為是 ? 折疊股中額外插入的一個殘基，它使得在兩個正常氫鍵之間、在凸起折疊股上是兩個殘基，而另一側的正常股上的一個殘基。 ? 凸起可引起多肽鏈方向的改變，但改變的程度不如 ? 轉角。目錄（四）無規卷曲指沒有一定規律的松散肽鏈結構，是用來闡述沒有確定規律性的那部分肽鏈結構。此結構看來雜亂無章，但對一種特定蛋白又是確定的，而不是隨意的。在球狀蛋白中含有大量無規卷曲，傾向于產生球狀構象。這種結構有高度的特異性，與生物活性密切相關，對外界的理化因子極為敏感。酶的活性中心往往位于無規卷曲中。通過主鏈間及主鏈與側鏈間氫鍵維持其構象．不同的蛋白質，自由回轉的數量和形式各不相同．除以上常見二級結構單元外，還有其他新發現的結構，如 Ω 環，由 10個殘基組成，象希臘字母 Ω 。目錄 α螺旋 β折疊片 β轉角無規則卷曲目錄思考：維持蛋白質二級結構的作用力是？肽鍵衍生而來的氫鍵纖維狀蛋白只有二級結構，例如毛發與肌肉蛋白（五）、超二級結構和結構域 (P220，掌握 ) 隨著對蛋白質空間結構研究的深入，在二級結構和三級結構之間還可以進一步細分為超二級結構和結構域。目錄（１）超二級結構（掌握）在蛋白質分子中，由若干相鄰的二級結構單元組合在一起，彼此相互作用，形成有規則的、在空間上能辨認的二級結構組合體。幾種類型的超二級結構： ?? ；?? ； ??? ； ★超二級結構在結構層次上高于二級結構，但沒有聚集成具有功能的結構域． α α ββ βαβ 目錄（２）結構域（ P222,掌握）多肽鏈在二級結構或超二級結構的基礎上形成三級結構的局部折疊區，它是相對獨立的緊密球狀實體，稱為結構域。 *對于那些較小的蛋白質分子或亞基來說，結構域和三級結構是一個意思，也就是說這些蛋白質或亞基是單結構域的，如紅氧還蛋白、肌紅蛋白等； *對于較大的球狀蛋白質或亞基，其三級結構往往由兩個或多個結構域締合而成也即它們是多結構域的，如免疫球蛋白的每條輕鏈含有兩個結構域。 ① 結構域一般由 100200個氨基酸殘基組成，但大小范圍可達 40400個殘基。氨基酸可以是連續的，也可以是不連續的．目錄 ② 結構域之間常形成裂隙，比較松散，常是活性部位，也是反應物的出入口。一般情況下，酶的活性部位位于兩個結構域的裂縫中。往往也是蛋白質優先被水解的部位。 ③ 結構域之間由 “ 鉸鏈區 ” 相連，使分子構象有一定的柔性，通過結構域之間的相對運動，使蛋白質分子實現一定的生物功能。 ④ 在蛋白質分子內結構域可作為結構單位進行相對獨立的運動，水解出來后仍能維持穩定的結構，甚至保留某些生物活性．目錄 ★ 結構域與功能域的關系：結構域有時也指功能域，功能域是蛋白質分子中能獨立存在的功能單位。功能域可以是一個結構域，也可以是由 2個結構域或 2個以上結構域組成，例如幾糖激酶的功能域是由兩個結構域構成，并處于它們之間的交界處。 ① 有時一個結構域就是蛋白質的功能域，但不總是． ② 包含一個但通常是多個結構域免疫球蛋白結構域目錄三、蛋白質的三級結構蛋白質的三級結構是指多肽鏈在二級結構的基礎上進一步盤旋、折疊，從而生成特定的空間結構。包括主鏈和側鏈的所有原子的空間排布．一般非極性側鏈埋在分子內部，形成疏水核，極性側鏈在分子表面。球狀蛋白質分子特有的結構。（一）定義 (P224，掌握 ) 目錄（二）三級結構的特征（球狀蛋白 ,P228，熟悉）（ 1）含多種二級結構元件。 —— 不同球狀蛋白質中各種元件的含量不同。（ 2）具有明顯的折疊層次。在一級序列上相鄰的二級結構往往在三維折疊中彼此靠近并相互作用形成超二級結構。由超二級結構進一步裝配成相對獨立的球狀實體 ―― 結構域或三級結構，或再由兩個或多個結構域裝配成緊密的球狀或橢球狀的三級結構。如果是亞基的三級結構，將由三級結構的亞基締合成四級結構的多聚體。目錄（ 3）緊密的球狀或橢球狀實體。多肽鏈折疊過程中各種二級結構彼此緊密裝配，它們之間也插入松散的肽段。整個蛋白質的大約 75％被氨基酸占據，大約有 25％以空腔形式存在，鄰近活性部位的區域密度比平均值低得多，這可能意味著這較松散的區域有

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